RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM222Q9H0R3 208 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TACC2O95359 2948 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX22C9J3V5 150 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM157AC9JC47 383 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCGR3BO75015 233 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNAPC5O75971 98 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HPRT1P00492 218 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HRASP01112 189 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SULT1A3P0DMM9 295 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SULT1A4P0DMN0 295 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LGALS7P47929 136 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MOB3BQ86TA1 216 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX29Q8N6K0 151 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRTM2Q8N967 370 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRAPQ8TCY5 172 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LHX4Q969G2 390 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TP53RKQ96S44 253 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXC2Q99958 501 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATG101Q9BSB4 218 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AGMATQ9BSE5 352 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHIAQ9BZP6 476 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPM3Q9P2X0 92 aa4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MED13LQ71F56 2210 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMCO3A2RU48 225 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OOSP1A8MZH6 123 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 J3QLI3 93 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0R143 59 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDS2O95674 445 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FSHBP01225 129 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VDAC1P21796 283 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE2E1P51965 193 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAX8Q06710 450 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXL1Q12952 345 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSX7Q7RTT5 188 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STPG2Q8N412 459 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q8N7P7 452 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR1S1Q8NH92 325 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf50Q96LR7 162 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLCC1Q96S66 551 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NMES1Q9C002 83 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MMP26Q9NRE1 261 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.54□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPN13Q12923 2485 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PRD5 423 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PRF3 423 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PRM7 423 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXorf65A6NEN9 183 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIX6O95475 246 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR8U8P0C7N1 319 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRS3P32247 399 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMPP49913 170 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POU2AF1Q16633 256 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIDNQ504T8 468 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD13Q5VXD3 122 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR4A16Q8NH70 328 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THAP6Q8TBB0 222 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEC22AQ96IW7 307 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C18orf12Q96KH6 178 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00052Q96N35 136 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
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