RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AAED1Q7RTV5 226 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C10orf111Q8N326 155 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COPS9Q8WXC6 57 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAXXQ9BUH6 204 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.62□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PGPA6NDG6 321 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TLCD2A6NGC4 264 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNURFLB1AK76 121 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PATE3B3GLJ2 98 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UPK2O00526 184 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SOCS1O15524 211 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFS5O43920 106 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PMS2P2O95744 297 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SFTA3P0C7M3 94 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SDC2P34741 201 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OPRM1P35372 400 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASIPP42127 132 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EFEMP1Q12805 493 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q56UQ5 140 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM57BQ71RH2 274 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCL17Q92583 94 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MCEEQ96PE7 176 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RARRES3Q9UL19 164 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 V9GYH0 126 aa5.61□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H3BP45 60 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLA2G10O15496 165 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LYRM1O43325 122 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PYYP10082 97 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCL23P55773 120 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CACNG7P62955 275 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 QRFPP83859 136 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EBI3Q14213 229 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TGIF1Q15583 401 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C18orf12Q96KH6 178 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VSIG4Q9Y279 399 aa5.6□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF727A8MUV8 499 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H0Y9J4 135 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNCGO76070 127 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NGFP01138 241 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOC2P02655 101 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRGC2P03986 189 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HLA-DOBP13765 273 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSMB2P49721 201 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPATA45Q537H7 98 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BRK1Q8WUW1 75 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNS1Q96KK3 526 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.59□□□□□ -1.51
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.58□□□□□ -1.52
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms