RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 DDB2Q92466 427 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF503Q96F45 646 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF492Q9P255 531 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PTPRBP23467 1997 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 G3V4G9 280 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MGST3O14880 152 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SIVA1O15304 175 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 HTR1DP28221 377 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CSN1S1P47710 185 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CAMPP49913 170 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC01545Q5VT33 79 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SSX8Q7RTT4 187 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PAXXQ9BUH6 204 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 KNL1Q8NG31 2342 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GW15 77 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 C9orf118A6NHY6 69 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CHEK1O14757 476 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 COX7A2P2O60397 106 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 APOA2P02652 100 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CD69Q07108 199 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR82Q6UXN9 313 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF329Q86UD4 541 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 RFESDQ8TAC1 157 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 Q8TCH9 128 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FMC1Q96HJ9 113 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR82Q96P67 336 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 U3KQA8 63 aa6.16□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 HCFC1P51610 2035 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 hDV102S1A0JD36 115 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 K7EP34 96 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 DLL1O00548 723 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PROP1O75360 226 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 P01737 135 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CELA3BP08861 270 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PRDX2P32119 198 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 LTBRP36941 435 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SAP25Q8TEE9 199 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM168AQ92567 244 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TNFRSF14Q92956 283 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.15□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 PINLYPA6NC86 204 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 C9orf172C9J069 976 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 UPK2O00526 184 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 MPV17P39210 176 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 RBPJQ06330 500 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 HSD52Q0P140 79 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 PDPNQ86YL7 162 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 SVIPQ8NHG7 77 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 HINT2Q9BX68 163 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.14□□□□□ -1.43
HMBOX1-211ENST00000524238 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms