RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	LGALS7	P47929	136 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	ARF6	P62330	175 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	FAM210B	Q96KR6	192 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	TNXA	Q16473	311 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	TRGC2	P03986	189 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	LIPF	P07098	398 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	RPE	Q96AT9	228 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.77	□□□□□ -0.2
MEG3-222	ENST00000524035	PSG5	Q15238	335 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	CDKN1A	P38936	164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	LGALS4	P56470	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	PRSS8	Q16651	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	NPIPB3	Q92617	1050 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035		F6UZH7	168 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	UBE2C	O00762	179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	NDUFS7	O75251	213 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	AREG	P15514	252 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035		H7BYZ3	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	CRYGB	P07316	175 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	HNF1A	P20823	631 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	KLRD1	Q13241	179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	DOK5	Q9P104	306 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	RBP4	P02753	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF90	Q03938	601 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1W2PRD5	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1W2PRF3	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1W2PRM7	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	AP4M1	O00189	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	GALR1	P47211	349 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	MFAP2	P55001	183 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	CLN5	O75503	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	MT-CO2	P00403	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	OR10J4	P0C629	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	OR7C2	O60412	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	VENTX	O95231	258 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	GNLY	P22749	145 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	FCN1	O00602	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	SFTPC	P11686	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	C12orf57	Q99622	126 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	TIMM23	O14925	209 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	OR5G3	P0C626	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	NDUFA6	P56556	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-222	ENST00000524035	HIST1H2BK	O60814	126 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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