RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 GAPTQ8N292 157 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 DMXL1Q9Y485 3027 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 C21orf140B9A014 251 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 SIVA1O15304 175 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 FAM87AP0C7U9 286 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 FABP2P12104 132 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 PCBD1P61457 104 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 C3AR1Q16581 482 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 HES3Q5TGS1 186 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZS49 121 aa7□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 GPHA2Q96T91 129 aa7□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 UQCRFS1P47985 274 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 SPINK4O60575 86 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 RAX2Q96IS3 184 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1D-12P01611 117 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 PDCD1Q15116 288 aa6.98□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.98□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.98□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 C11orf52Q96A22 123 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 VGLL1Q99990 258 aa6.98□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.97□□□□□ -1.29
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TRPS1-209ENST00000519674 Q8N7P7 452 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 C5orf49A4QMS7 147 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 HELTA6NFD8 242 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC30A6NM36 301 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 TUSC2O75896 110 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-209ENST00000519674 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.97□□□□□ -1.29
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