RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRB	P23467	1997 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	UPK2	O00526	184 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2J3	O76001	311 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	AGFG2	O95081	481 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FSTL3	O95633	263 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LHB	P01229	141 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHG3	P01860	377 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	APCS	P02743	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CECR9	P0C854	216 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MYOD1	P15172	320 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SELENOV	P59797	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PSG5	Q15238	335 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MMD	Q15546	238 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CORO2A	Q92828	525 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GXF2	115 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C20orf202	A1L168	122 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746		H0YJW9	148 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ACTL6B	O94805	426 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PMCH	P20382	165 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPO	P30536	169 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SRI	P30626	198 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MYCNOS	P40205	109 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TFPI2	P48307	235 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	AMT	P48728	403 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TCL1A	P56279	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ARG2	P78540	354 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SLA	Q13239	276 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FXYD3	Q14802	87 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LTC4S	Q16873	150 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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