RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 UTF1Q5T230 341 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR8H1Q8NGG4 311 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 GPR146Q96CH1 333 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 C5orf30Q96GV9 206 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 SEC22AQ96IW7 307 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 ENY2Q9NPA8 101 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 COA4Q9NYJ1 87 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 PRNDQ9UKY0 176 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PPI3 338 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 GPR137BO60478 399 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IFNA17P01571 189 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 H2BFSP57053 126 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 LINC00205P59089 165 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 S100A10P60903 97 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 UBE2KP61086 200 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 AANATQ16613 207 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 POU2AF1Q16633 256 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 NMSQ5H8A3 153 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 SSX9Q7RTT3 188 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 HYLS1Q96M11 299 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 NEURL2Q9BR09 285 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 BET1LQ9NYM9 111 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 CACNG5Q9UF02 275 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 VENTXO95231 258 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1D-33P01593 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1-33P01594 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1-39P01597 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1-5P01602 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 C1QBP02746 253 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1-16P04430 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1D-39P04432 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 PRSS2P07478 247 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 MAS1LP35410 378 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 DYNLT3P51808 116 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 SPCS3P61009 180 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR4A47Q6IF82 309 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 WDR73Q6P4I2 378 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 MMD2Q8IY49 270 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR10C1Q96KK4 312 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 RAB40CQ96S21 281 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 A0A0U1RQK1 487 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PN81 502 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 E5RGE8 158 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 M0QZK8 103 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 UPK2O00526 184 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 UBE2CO00762 179 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 NBR2O15453 112 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CYB5BO43169 146 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 KBTBD11O94819 623 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CNIH1O95406 144 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 MPC2O95563 127 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 FAM157CP0CG43 387 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A4P12235 298 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 CHRNA7P36544 502 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PSG5Q15238 335 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 MMDQ15546 238 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-210ENST00000512194 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms