RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PLXNA2	O75051	1894 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	BSPH1	Q075Z2	132 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MUC21	Q5SSG8	566 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PEX7	O00628	323 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	EFNB3	Q15768	340 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	OR5R1	Q8NH85	324 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	KCNS1	Q96KK3	526 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	DERL1	Q9BUN8	251 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C15orf61	A6NNL5	157 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	UPK2	O00526	184 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM50A	O95807	157 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PYY	P10082	97 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CD59	P13987	128 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TBR1	Q16650	682 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TREML4	Q6UXN2	200 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	OR52E5	Q8NH55	327 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CACNA1A	O00555	2505 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	OR4C46	A6NHA9	309 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf100	A8MU93	164 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PYY3	Q5JQD4	70 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TM4SF5	O14894	197 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CEACAM1	P13688	526 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ADM	P35318	185 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	HBB	P68871	147 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ASCL4	Q6XD76	172 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		A6NDN8	102 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SRRM5	B3KS81	715 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	AMBP	P02760	352 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LIPF	P07098	398 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	BMI1	P35226	326 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LOXL3	P58215	753 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TEX38	Q6PEX7	206 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00473	A8K010	186 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	GNG5	P63218	68 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LEMD1	Q68G75	181 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		Q6P435	159 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	MED13	Q9UHV7	2174 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-23	P01764	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-DRB1	P01911	266 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FAM106CP	P0CH98	169 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	LYNX1	P0DP58	116 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	NTF4	P34130	210 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	TFPI2	P48307	235 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf83	Q53S99	150 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193	HIGD1C	A8MV81	97 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NEK1-208	ENST00000512193		B9A039	149 aa		6.68	□□□□□ -1.34

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