RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CFHR4Q92496 578 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 RPEQ96AT9 228 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TVP23CQ96ET8 276 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 YPEL4Q96NS1 127 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 MANBALQ9NQG1 85 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 DPM3Q9P2X0 92 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP9Q99996 3911 aa8.65□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 APCP25054 2843 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WWC5 75 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM250H0YL14 139 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYGCP07315 174 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFA4P12838 97 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 B2MP61769 119 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 LMO4P61968 165 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 STPG3Q8N7X2 389 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF114Q8NC26 417 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf50Q8WW18 174 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SIRPDQ9H106 197 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 PDZD2O15018 2839 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPV4 95 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 VENTXO95231 258 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 FOLR2P14207 255 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10J1P30954 320 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 THAP8Q8NA92 274 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35E1Q96K37 410 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TNCP24821 2201 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OOSP1A8MZH6 123 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 B4DEV8 164 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX22C9J3V5 150 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TIMM23O14925 209 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 PAGE4O60829 102 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CXorf1O96002 111 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CD99P14209 185 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NPPCP23582 126 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CEBPGP53567 150 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MFAP2P55001 183 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 RHOBP62745 196 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 KLRD1Q13241 179 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NPBQ8NG41 125 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXL15Q9H469 300 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMB11A5LHX3 300 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 FCN1O00602 326 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFA3O95167 84 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-39P01824 125 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MT-ND4LP03901 98 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYBA1P05813 215 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CEACAM3P40198 252 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 EBI3Q14213 229 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TNXAQ16473 311 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF212Q495C1 297 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CXorf65A6NEN9 183 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF727A8MUV8 499 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5G3P0C626 314 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 AREGP15514 252 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 GCHFRP30047 84 aa8.6□□□□□ -1.03
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