RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493976.1

AKAP9-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-215	ENST00000493976	HPGDS	O60760	199 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	IGKV1-5	P01602	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	APOA1	P02647	267 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	PI3	P19957	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	RCVRN	P35243	200 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	MFAP4	P55083	255 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	UCP3	P55916	312 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	VBP1	P61758	197 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	ST8SIA2	Q92186	375 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	AGRN	O00468	2067 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976		P0C879	139 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	TP53RK	Q96S44	253 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	TXN2	Q99757	166 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AKAP9-215	ENST00000493976	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.65	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A087WXM4	84 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	GNG7	O60262	68 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A0B4J293	547 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A1B0GU03	582 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	DEDD	O75618	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	KLK11	Q9UBX7	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	DFFB	O76075	338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	S100G	P29377	79 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PIGP	P57054	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	RND3	P61587	244 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	LEMD1	Q68G75	181 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	RARRES2	Q99969	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	DEFB4A	O15263	64 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	CD3D	P04234	171 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PPP5C	P53041	499 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	OR52I2	Q8NH67	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PGAM2	P15259	253 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	AKR1C2	P52895	323 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	DEFB131A	P59861	70 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	SP6	Q3SY56	376 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	OR11H2	Q8NH07	326 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	GINS3	Q9BRX5	216 aa		11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM50A	O95807	157 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	ETV6	P41212	452 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	NPBWR1	P48145	328 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MLANA	Q16655	118 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976		Q6ZRM9	215 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	ABHD1	Q96SE0	405 aa		11.59	□□□□□ -0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM25A	B3EWG3	89 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM25C	B3EWG5	89 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM25G	B3EWG6	89 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	IFNA17	P01571	189 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SNCA	P37840	140 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CTF1	Q16619	201 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		11.58	□□□□□ -0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.58	□□□□□ -0.56

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