RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 CTSZQ9UBR2 303 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 SHISA9B4DS77 424 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 F2Z2F3 143 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 DLEU1O43261 78 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 DLX1P56177 255 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 STPG3Q8N7X2 389 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ZNF320A2RRD8 509 aa10.46□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 LINC01551Q86U37 167 aa10.46□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 TEPPQ6URK8 271 aa10.45□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 STAG3L3P0CL85 134 aa10.45□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 EFNB3Q15768 340 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 ACTL10Q5JWF8 245 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 DNLZQ5SXM8 178 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.45□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 RAB1CQ92928 201 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 LINC00869P0C866 280 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 SPINK4O60575 86 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 C10orf55Q5SWW7 151 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 MIR17HGQ75NE6 70 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 OR10X1Q8NGY0 326 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 SCO2A0A1W2PP80 73 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 GCHFRP30047 84 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZWC4 215 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 OR4P4Q8NGL7 312 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 RITA1Q96K30 269 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 CXorf1O96002 111 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-48P01763 117 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 CBLN1P23435 193 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 ADMP35318 185 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 TMEM249Q2WGJ8 235 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 LRRC10Q5BKY1 277 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 OR9G1Q8NH87 305 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 APOA2P02652 100 aa10.42□□□□□ -0.74
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