RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487861.5

RAD51B-211, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-211ENST00000487861 ZFHX3Q15911 3703 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 AGPAT2O15120 278 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 IGHV3-48P01763 117 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 GATA3P23771 443 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 RAB2AP61019 212 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 BLOC1S1P78537 153 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 NDPQ00604 133 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 AKR1C1Q04828 323 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 FXYD3Q14802 87 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 TMEM219Q86XT9 240 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 Q8N9W7 124 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 MGST2Q99735 147 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 GGACTQ9BVM4 153 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.46□□□□□ -1.37
RAD51B-211ENST00000487861 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 UMAD1C9J7I0 102 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 TRIM77I1YAP6 450 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 S100A1P23297 94 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 RAB5CP51148 216 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 CD69Q07108 199 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 GAMTQ14353 236 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SSX7Q7RTT5 188 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 PIFOQ8TCI5 191 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 MISP3Q96FF7 219 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SSX3Q99909 188 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 RPRMQ9NS64 109 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ITPR3Q14573 2671 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ITPR2Q14571 2701 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 I3L521 148 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 J3QLI3 93 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 DEFA4P12838 97 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 OPRK1P41145 380 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 CX3CL1P78423 397 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF726P1Q15940 193 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 LY6EQ16553 131 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 MIC13Q5XKP0 118 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF709Q8N972 641 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF114Q8NC26 417 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ARPC1AQ92747 370 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 MARC2Q969Z3 335 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 C1RLQ9NZP8 487 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.45□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 H3BUX3 64 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 TSPAN15O95858 294 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 CCL20P78556 96 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SERF2P84101 59 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 TOR2AQ5JU69 321 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 TEPPQ6URK8 271 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 ACY3Q96HD9 319 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 SLC35E1Q96K37 410 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.44□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 LINC01548A6NM66 108 aa6.43□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 FNDC10F2Z333 226 aa6.43□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RAD51B-211ENST00000487861 MPDU1O75352 247 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms