RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 C17orf50Q8WW18 174 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ACANP16112 2415 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX22C9J3V5 150 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MSMBP08118 114 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 M6PRP20645 277 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 BRS3P32247 399 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL20P78556 96 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 LCN15Q6UWW0 184 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 AJUBAQ96IF1 538 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC35E1Q96K37 410 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 P2RX4Q99571 388 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ZANQ9Y493 2812 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.28□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 F8W036 122 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FCN1O00602 326 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CYB5BO43169 146 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CNIH1O95406 144 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV1-69P01742 117 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 APOC3P02656 99 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 REG1AP05451 166 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SFTA3P0C7M3 94 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM106CPP0CH98 169 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 AREGP15514 252 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM11P17152 192 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CD24P25063 80 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PAX6P26367 422 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 GAMTQ14353 236 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 Q5PR19 223 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 MIC13Q5XKP0 118 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SSX7Q7RTT5 188 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf159Q96HA4 380 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SEC11CQ9BY50 192 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A22Q9H936 323 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 B4DSR2 109 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C9JQL5 133 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CORTO00230 105 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPAN9O75954 239 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 YIF1AO95070 293 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ADCYAP1P18509 176 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PPT1P50897 306 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 B2MP61769 119 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FBLN7Q53RD9 439 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 STPG3Q8N7X2 389 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 OR1P1Q8NH06 330 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SMR3AQ99954 134 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C1RLQ9NZP8 487 aa8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.26□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNA1P01562 189 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FOSL1P15407 271 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 GATA3P23771 443 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFA5Q01523 94 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FXYD3Q14802 87 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 HAGHQ16775 308 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SVBPQ8N300 66 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms