RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFNA17P01571 189 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV1-51P01701 117 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4E1P0C645 316 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARL3P36405 182 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 DEFA6Q01524 100 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TNFRSF9Q07011 255 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPHB5Q86YW7 130 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 MITD1Q8WV92 249 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 NUDT15Q9NV35 164 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPP5D1E7EU14 171 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TGOLN2O43493 480 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TCRBP04435 133 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR183P32249 361 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 HTR2BP41595 481 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SYNJ2BPP57105 145 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFITM3Q01628 133 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 C2orf83Q53S99 150 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPINK9Q5DT21 86 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TXN2Q99757 166 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 PEMTQ9UBM1 199 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM213A2RRL7 107 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SAP30O75446 220 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 MT-CO2P00403 227 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV3-23P01764 117 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 CSN3P07498 182 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 NPY1RP25929 384 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADMP35318 185 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SNCAP37840 140 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 C4orf46Q504U0 113 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 COQ8AQ8NI60 647 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 DTD1Q8TEA8 209 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ENY2Q9NPA8 101 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 S4R3C0 116 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2T8A6NH00 312 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 C2orf70A6NJV1 201 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 K7EIL1 84 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 NDUFA4O00483 81 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 LY86O95711 162 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLEC3BP05452 202 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 CTSGP08311 255 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.45e-9■□□□□ 9.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TATDN3Q17R31 274 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR1S1Q8NH92 325 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 MARC2Q969Z3 335 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 MISP3Q96FF7 219 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 RBKSQ9H477 322 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADAP1O75689 374 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2C1O95371 312 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 IL5P05113 134 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 C8orf88P0DMB2 117 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 MFAP4P55083 255 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLET1Q6UQ28 207 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 NOXA1Q86UR1 476 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4X1Q8NH49 305 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10C1Q96KK4 312 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4C12Q96R67 309 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms