RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 YIF1AO95070 293 aa15□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TRGC2P03986 189 aa15□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 DNLZQ5SXM8 178 aa15□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 SMCO3A2RU48 225 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 MARCH11A6NNE9 402 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 B4DSR2 109 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R2P9O14990 202 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
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CAPN3-209ENST00000466222 ZNF137PP52743 207 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 OR52E5Q8NH55 327 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 R3HDM4Q96D70 268 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 GGACTQ9BVM4 153 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 SLC25A22Q9H936 323 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.99□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ODF3BA8MYP8 253 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 MPDU1O75352 247 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 AVPP01185 164 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 KIR2DS2P43631 304 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM186Q96B77 213 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 NABP2Q9BQ15 211 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 LY6LH3BQJ8 138 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 BSXQ3C1V8 233 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 SSX9Q7RTT3 188 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 LINC00587B1AMM8 73 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 VENTXO95231 258 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TRGC1P0CF51 173 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 THBS3P49746 956 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 SPCS3P61009 180 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ADIRFQ15847 76 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RAB24Q969Q5 203 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 C1orf159Q96HA4 380 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.97□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 IFITM10A6NMD0 228 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 C15orf62A8K5M9 175 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 H0YJW9 148 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TGFAP01135 160 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 HTR1DP28221 377 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RITA1Q96K30 269 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ITPR3Q14573 2671 aa14.96□□□□□ -0.01
CAPN3-209ENST00000466222 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 OR5B12Q96R08 314 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 PARLQ9H300 379 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 DPM3Q9P2X0 92 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.96□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 PHOX2AO14813 284 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 CD24P25063 80 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 ERVK-16P61578 105 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 SSX2Q16385 188 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 FRZBQ92765 325 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 RPEQ96AT9 228 aa14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 H7BYZ3 331 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 IL3RAP26951 378 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 CD1BP29016 333 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 UBE2E1P51965 193 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 FBLN7Q53RD9 439 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 MOB3BQ86TA1 216 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 OR4F5Q8NH21 305 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 OR4A16Q8NH70 328 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 AJUBAQ96IF1 538 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 OR4F4Q96R69 305 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.94□□□□□ -0.02
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