RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 PYY3Q5JQD4 70 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 MMD2Q8IY49 270 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GWJ7 208 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 H3BVH4 76 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 OR2J3O76001 311 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 UQCRFS1P47985 274 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 WDR31Q8NA23 367 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 IGLV1-44P01699 117 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 CD1BP29016 333 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 CDKN1AP38936 164 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 RBKSQ9H477 322 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 GNB4Q9HAV0 340 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 IL36BQ9NZH7 164 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 PRNDQ9UKY0 176 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.41□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 K7N7A8 449 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 IGHV2-70P01814 119 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 PCSK4Q6UW60 755 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 OR9G1Q8NH87 305 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 CCL13Q99616 98 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 IL4P05112 153 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 MAS1LP35410 378 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 PSG7Q13046 419 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 RFESDQ8TAC1 157 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 KCNS1Q96KK3 526 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.4□□□□□ -1.38
USP54-210ENST00000466048 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SYNGR1O43759 233 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 FCGR3BO75015 233 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 RELBQ01201 579 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ST20Q9HBF5 79 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MED13Q9UHV7 2174 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 B4DSR2 109 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 NAPSAO96009 420 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CGAP01215 116 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LGALS7P47929 136 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SELENOTP62341 195 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TMEM230Q96A57 120 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 JPT1Q9UK76 154 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 PSG11Q9UQ72 335 aa6.4□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ODAMA1E959 279 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 AMBPP02760 352 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 NPY1RP25929 384 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 PDCD1Q15116 288 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TMEM186Q96B77 213 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 METRNQ9UJH8 293 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LRTM2Q8N967 370 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 RAB37Q96AX2 223 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR4C46A6NHA9 309 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CELA3BP08861 270 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 AREGP15514 252 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TDGF1P3P51864 188 aa6.39□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GWB2 263 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TGFAP01135 160 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OPRK1P41145 380 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TMEM187Q14656 261 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF146Q15072 292 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 HIST1H4GQ99525 98 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 EFNB3Q15768 340 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms