RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G10	O15496	165 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	LYRM1	O43325	122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902		Q56UQ5	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	PRR25	Q96S07	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902		K7EIM0	57 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	BTC	P35070	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	NMS	Q5H8A3	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902		K7EIL1	84 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	TGOLN2	O43493	480 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	MT-CO2	P00403	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	HOXB5	P09067	269 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	C4orf46	Q504U0	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	C9orf170	A2RU37	121 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	CSN3	P07498	182 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	OR4E1	P0C645	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	SPN	P16150	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	MFAP4	P55083	255 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GU03	582 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902		I3L2K1	104 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	LGALS9	O00182	355 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	CORT	O00230	105 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TCRB	P04435	133 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	HTR2B	P41595	481 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF9	Q07011	255 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	DHRS2	Q13268	280 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	GNG7	O60262	68 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	OPRK1	P41145	380 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	RBKS	Q9H477	322 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	UPK1B	O75841	260 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	IFNA10	P01566	189 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	FOLR2	P14207	255 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	GP9	P14770	177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	EDN2	P20800	178 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	NPBWR1	P48145	328 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TXN2	Q99757	166 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	ADAP1	O75689	374 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	YIF1A	O95070	293 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	IFNA21	P01568	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	CTSG	P08311	255 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	CBLN1	P23435	193 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	NPY1R	P25929	384 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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