RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462032.1

EPB41-209, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, human

TSL 2

Gene EPB41, Length 752 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41-209	ENST00000462032	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032		M0R1W7	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	YIF1A	O95070	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	GOSR1	O95249	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SOD3	P08294	240 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	FBP1	P09467	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MAS1L	P35410	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CEBPG	P53567	150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	B2M	P61769	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	NF1	P21359	2839 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032		A6NNC1	897 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	COLCA2	A8K830	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	C22orf46	C9J442	243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032		F6UZH7	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SLC25A17	O43808	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	TSPAN9	O75954	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CXorf1	O96002	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MT-CO2	P00403	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	OPN1MW	P04001	364 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	IGFBP2	P18065	325 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	COX7A1	P24310	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	AKR1C3	P42330	323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CD81	P60033	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RHOB	P62745	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CD69	Q07108	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RNF212	Q495C1	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	PNKD	Q8N490	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RPE	Q96AT9	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RNF5	Q99942	180 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MLX	Q9UH92	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032		A0A1W2PPI3	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	PDE6D	O43924	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	PAGE4	O60829	102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	LY6H	O94772	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	OR2C1	O95371	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CRYGB	P07316	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	CEACAM3	P40198	252 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	RAB5B	P61020	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	PAX2	Q02962	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	PSG5	Q15238	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	TNXA	Q16473	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	PRSS8	Q16651	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EPB41-209	ENST00000462032	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms