RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458009.5

MLH1-215, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 1 (best)

Gene MLH1, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-215	ENST00000458009	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OXT	P01178	125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	APOA1	P02647	267 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	AREG	P15514	252 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	MGMT	P16455	207 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GABRB1	P18505	474 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	C4BPB	P20851	252 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GCSH	P23434	173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	BDKRB2	P30411	391 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	DAD1	P61803	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SLA	Q13239	276 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	IL18	Q14116	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RAB27B	O00194	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	CRHBP	P24387	322 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ASIP	P42127	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OR2B8P	P59922	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	EFNB1	P98172	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009		Q56UQ5	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GGH	Q92820	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009		Q9H521	79 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	HELT	A6NFD8	242 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	SRM	P19623	302 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GNRHR	P30968	328 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RAP2B	P61225	183 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RAB32	Q13637	225 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	OXA1L	Q15070	435 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	PTX4	Q96A99	478 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009		Q9H3A6	140 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-215	ENST00000458009	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MLH1-215	ENST00000458009		F5H768	121 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MLH1-215	ENST00000458009		K7EQM0	130 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MLH1-215	ENST00000458009	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms