RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR8U1Q8NH10 309 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM18Q96B42 140 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CCL13Q99616 98 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TLNRD1Q9H1K6 362 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 RNF150Q9ULK6 438 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GWJ7 208 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PPE2 198 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PR64 198 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PRV1 198 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NKX6-3A6NJ46 265 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 H0Y980 276 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SOX15O60248 233 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IFNA4P05014 189 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR5AC1P0C628 307 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SNCAP37840 140 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NPBWR2P48146 333 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HERV-K104P61576 105 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GNG3P63215 75 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35B1P78383 322 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 DEFA5Q01523 94 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NMSQ5H8A3 153 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 FBXW12Q6X9E4 464 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF429Q86V71 674 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CMTM1Q8IZ96 169 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PIGCQ92535 297 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SLAMF9Q96A28 289 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 MALSU1Q96EH3 234 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CABLES2Q9BTV7 478 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 COA4Q9NYJ1 87 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 KAAG1Q9UBP8 84 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 FBXL17Q9UF56 701 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PPH5 198 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 A6NLC8 198 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM210A6NLX4 147 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CD300LBA8K4G0 201 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 COLCA2A8K830 154 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 DEGS1O15121 323 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 MLNRO43193 412 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 DFFBO76075 338 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 MT-ND4LP03901 98 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CFC1BP0CG36 223 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CFC1P0CG37 223 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ADCYAP1P18509 176 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 COX7A1P24310 79 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LPAR6P43657 344 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ERVK11-1P61568 191 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 S100A12P80511 92 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 PRDX4Q13162 271 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF146Q15072 292 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 RHEBQ15382 184 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SSX2Q16385 188 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HAGHQ16775 308 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SPIN3Q5JUX0 258 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 CALHM1Q8IU99 346 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 RAB40CQ96S21 281 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 OR51I2Q9H344 312 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-211ENST00000429595 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms