RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 M0QYG6 137 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 GNG7O60262 68 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 P0C879 139 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 PVRIGQ6DKI7 326 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 MZT2AQ6P582 158 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 AP3S1Q92572 193 aa15.5■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf65A6NEN9 183 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 YIF1AO95070 293 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM217Q8N7C4 229 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 GINS3Q9BRX5 216 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 KLK11Q9UBX7 282 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 ATG12O94817 140 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 GABARAPO95166 117 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-5P01602 117 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 NPBWR1P48145 328 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 PIGPP57054 158 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 TP53RKQ96S44 253 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 FAM25AB3EWG3 89 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 FAM25CB3EWG5 89 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 FAM25GB3EWG6 89 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 CORTO00230 105 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 PGAM2P15259 253 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 PMS2P11Q13670 270 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP18Q8NEJ0 188 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 VSIRQ9H7M9 311 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0B4J293 547 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 B3GALNT1O75752 331 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 CD3DP04234 171 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1C2P52895 323 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 PAFAH1B2P68402 229 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 CTF1Q16619 201 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35G3Q8N808 338 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 OR52I2Q8NH67 350 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV2A0A0B4J234 112 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ST8SIA3O43173 380 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-48P01763 117 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 CD74P04233 296 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 PI3P19957 117 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 SNCAP37840 140 aa15.45■□□□□ 0.06
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF600Q6ZNG1 722 aa15.45■□□□□ 0.06
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LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15.44■□□□□ 0.06
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LIMS1-208ENST00000428064 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM229BQ8NBD8 167 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 TERB2Q8NHR7 220 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 MPTX1A8MV57 137 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 DFFBO76075 338 aa15.43■□□□□ 0.06
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LIMS1-208ENST00000428064 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 TFPI2P48307 235 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R19P59542 299 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF124Q15973 351 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 AARDQ4LEZ3 155 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK9Q5DT21 86 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ST8SIA2Q92186 375 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD1Q96SE0 405 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 COPZ2Q9P299 210 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM50AO95807 157 aa15.42■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 PPP5CP53041 499 aa15.42■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 BSXQ3C1V8 233 aa15.42■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.42■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 KMT2AQ03164 3969 aa15.42■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 LY6G6CO95867 125 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 APOHP02749 345 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM18P0DKX4 95 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM16LQ309B1 348 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 FAM219AQ8IW50 185 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.41■□□□□ 0.06
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