RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UQCC3Q6UW78 93 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 P2RX4Q99571 388 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MGST2Q99735 147 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TREM1Q9NP99 234 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.82□□□□□ -1.16
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BTBD17A6NE02 478 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TEX22C9J3V5 150 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBR2O15453 112 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ACTL6BO94805 426 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NDUFA3O95167 84 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APELAP0DMC3 54 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOSL1P15407 271 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AREGP15514 252 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAS1LP35410 378 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EBI3Q14213 229 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q8N6K4 173 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPBQ8NG41 125 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA1O95477 2261 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0U1RQK1 487 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM218A2RU14 115 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YIF1AO95070 293 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FSHBP01225 129 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD5P06127 495 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADCYAP1P18509 176 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MFAP2P55001 183 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GUK1Q16774 197 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LCN15Q6UWW0 184 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COMMD1Q8N668 190 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF709Q8N972 641 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM160Q9NX00 188 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FNDC10F2Z333 226 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCO1O75880 301 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFA4P12838 97 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD69Q07108 199 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GAMTQ14353 236 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MIC13Q5XKP0 118 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSX3Q99909 188 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 M0QZK8 103 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MPDU1O75352 247 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HBE1P02100 147 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD99P14209 185 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OPRK1P41145 380 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TEPPQ6URK8 271 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LFNGQ8NES3 379 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR5R1Q8NH85 324 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RARRES2Q99969 163 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC25A22Q9H936 323 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDZD2O15018 2839 aa7.79□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.78□□□□□ -1.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
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