RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PSG11Q9UQ72 335 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HYPMO75409 117 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CA2P00918 260 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRX1P54821 245 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 STUMQ69YW2 141 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 NECAP1Q8NC96 275 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNRF1Q8ND25 227 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8B3Q8NGG8 313 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM18Q96B42 140 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8B2Q96RD0 313 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 F6UZH7 168 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4A47Q6IF82 309 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 UBALD2Q8IYN6 164 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZPBPQ9BS86 351 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 NAGKQ9UJ70 344 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OTX2P32243 289 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MEOX1P50221 254 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 EDDM3BP56851 147 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4P4Q8NGL7 312 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GALMQ96C23 342 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNRD1Q9P1U0 126 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TCAPO15273 167 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-43DP0DP04 118 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MAJINQ3KP22 176 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SPINK9Q5DT21 86 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPHD1Q5U4P2 390 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GCNT2Q8N0V5 402 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GP9P14770 177 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CEBPGP53567 150 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PLP1P60201 277 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOBP62745 196 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 NRN1Q9NPD7 142 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NNC1 897 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TSTD3H0UI37 97 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CD69Q07108 199 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZVH6 145 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYGBP07316 175 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00614P0C842 121 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX36Q5VZQ5 186 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF24Q7RTU0 167 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX15Q96SF7 602 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 APCP25054 2843 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOVP59797 346 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IQCJQ1A5X6 159 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM177Q53S58 311 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD5Q96DB9 178 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A10Q96PG2 267 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CALYQ9NYX4 217 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF212BA8MTL3 300 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC6AO75865 159 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDX2P32119 198 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOGP84095 191 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PIP4P1Q86T03 277 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GTSF1Q8WW33 167 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM122AQ96E09 287 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB108AA8MXU0 73 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 LYZL6O75951 148 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNA1P01562 189 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 THBS3P49746 956 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2G2P60604 165 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD39Q53RE8 183 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF714Q96N38 554 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GAFA1Q96PS6 74 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R143 59 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL25O15444 150 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CATR1Q13166 79 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD17BQ5VST6 288 aa2.91□□□□□ -1.94
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