RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
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PTPRJ-201ENST00000418331 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
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PTPRJ-201ENST00000418331 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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PTPRJ-201ENST00000418331 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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