RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 A8MWL6 223 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 APELAP0DMC3 54 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 LHX2P50458 406 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 HBBP68871 147 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 OR1L1Q8NH94 360 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ORM1P02763 201 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 CKS1BP61024 79 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF766Q5HY98 468 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 APC2O95996 2303 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TWIST1Q15672 202 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TNXAQ16473 311 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 CR1LQ2VPA4 569 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 Q6P435 159 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF785A8K8V0 405 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 OR2H2O95918 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 CA7P43166 264 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM186Q96B77 213 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 C5orf30Q96GV9 206 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 NBASA2RRP1 2371 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 OR2T8A6NH00 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 IQCF6A8MYZ5 107 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 STAG3L3P0CL85 134 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 DEPPQ9NTK1 212 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 COX11Q9Y6N1 276 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 PGPA6NDG6 321 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 IGKV1-39P01597 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 IGKV1D-39P04432 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 GAGE1Q13065 139 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 LCN12Q6JVE5 192 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 Q6ZRM9 215 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 C3orf79P0CE67 100 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TSPOP30536 169 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 HERVK_113P61574 105 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 DRAM1Q8N682 238 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 CST9LQ9H4G1 147 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 JPT1Q9UK76 154 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 PRNDQ9UKY0 176 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 PIEZO1Q92508 2521 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM189A5PLL7 270 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 C3orf80F5H4A9 247 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 MGST3O14880 152 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ANOS1P23352 680 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 NTF4P34130 210 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 Q6ZVH6 145 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 F5H697 171 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 J3QR06 171 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 DLL1O00548 723 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 J3KRW8 73 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 LILRA1O75019 489 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 SNCGO76070 127 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 IL4P05112 153 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 SSTR5P35346 364 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 MOB3BQ86TA1 216 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 DOCK7Q96N67 2140 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 IGHG3P01860 377 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 MUC21Q5SSG8 566 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 OCC1Q8TAD7 63 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 FAM222BQ8WU58 562 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 C18orf15Q96N68 181 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 hDV102S1A0JD36 115 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 SLC25A40Q8TBP6 338 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 RPEQ96AT9 228 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 NABP2Q9BQ15 211 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
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