RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 ABHD5Q8WTS1 349 aa16.07■□□□□ 0.16
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HDDC3-202ENST00000394272 HSPB9Q9BQS6 159 aa16.07■□□□□ 0.16
HDDC3-202ENST00000394272 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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HDDC3-202ENST00000394272 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.06■□□□□ 0.16
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HDDC3-202ENST00000394272 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.06■□□□□ 0.16
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HDDC3-202ENST00000394272 C22orf15Q8WYQ4 148 aa16.05■□□□□ 0.16
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF709Q8N972 641 aa16.02■□□□□ 0.16
HDDC3-202ENST00000394272 SGMS2Q8NHU3 365 aa16.02■□□□□ 0.16
HDDC3-202ENST00000394272 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.02■□□□□ 0.16
HDDC3-202ENST00000394272 GGTLC1Q9BX51 225 aa16.02■□□□□ 0.16
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HDDC3-202ENST00000394272 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.01■□□□□ 0.15
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HDDC3-202ENST00000394272 SLC35E1Q96K37 410 aa16.01■□□□□ 0.15
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HDDC3-202ENST00000394272 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.01■□□□□ 0.15
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HDDC3-202ENST00000394272 M0QZK8 103 aa16■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 AGPAT2O15120 278 aa16■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 CD5LO43866 347 aa16■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 IGHV4-59P01825 116 aa16■□□□□ 0.15
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HDDC3-202ENST00000394272 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.99■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 ACY3Q96HD9 319 aa15.99■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 FANCD2OSQ96PS1 177 aa15.99■□□□□ 0.15
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HDDC3-202ENST00000394272 IGHV3-48P01763 117 aa15.98■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 RAB31Q13636 194 aa15.98■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 OR5R1Q8NH85 324 aa15.98■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.97■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 MFSD2BA6NFX1 497 aa15.97■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 MBP02144 154 aa15.97■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 RPL29P47914 159 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 RAB2AP61019 212 aa15.97■□□□□ 0.15
HDDC3-202ENST00000394272 MIC13Q5XKP0 118 aa15.97■□□□□ 0.15
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