RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 B9D2Q9BPU9 175 aa11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF320A2RRD8 509 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 A8MWP6 167 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 IL7P13232 177 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 FOLR2P14207 255 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 BTCP35070 178 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ADMP35318 185 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 INPP1P49441 399 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 Q56UQ5 140 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 NMSQ5H8A3 153 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0B4J2A0 478 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SPCS3P61009 180 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CD69Q07108 199 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R1AQ13522 171 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 TM4SF20Q53R12 229 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 LGI3Q8N145 548 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N1Y9 231 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 OR52E5Q8NH55 327 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ENY2Q9NPA8 101 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 COL7A1Q02388 2944 aa11.29□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 A6NHS1 94 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ANXA3P12429 323 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CBLN1P23435 193 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 VAMP1P23763 118 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SNCAP37840 140 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 BSXQ3C1V8 233 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 LCN12Q6JVE5 192 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V0BQ99437 205 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 MLXQ9UH92 298 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.28□□□□□ -0.6
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFB6O95139 128 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 SFT2D2O95562 160 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 CTSGP08311 255 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 MFAP4P55083 255 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 SRPXP78539 464 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 ASCL2Q99929 193 aa11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF785A8K8V0 405 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFA4O00483 81 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 PLA2G10O15496 165 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf88P0DMB2 117 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 SMCO1Q147U7 214 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 BTNL8Q6UX41 500 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 PALMDQ9NP74 551 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.26□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF9Q07011 255 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 MLANAQ16655 118 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 LRTM2Q8N967 370 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 TXN2Q99757 166 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.25□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.24□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 GNG7O60262 68 aa11.24□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 CD7P09564 240 aa11.24□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.24□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 OPRK1P41145 380 aa11.24□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf83Q53S99 150 aa11.24□□□□□ -0.61
CSAG1-201ENST00000361211 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 803.6 ms