RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CCNKO75909 580 aa21.65■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 OR2J3O76001 311 aa21.65■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 PVRIGQ6DKI7 326 aa21.65■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 FAM223AQ8IWN6 122 aa21.65■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 OR5AC2Q9NZP5 309 aa21.65■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 C15orf62A8K5M9 175 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 OR8U8P0C7N1 319 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 CAV2P51636 162 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM170AQ8WVE7 144 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 MISP3Q96FF7 219 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 USMG5Q96IX5 58 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 MBD2Q9UBB5 411 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 FBXL7Q9UJT9 491 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0G2JLM5 398 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 IFNA4P05014 189 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 LCNL1Q6ZST4 164 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 OR4C12Q96R67 309 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 RNF126Q9BV68 326 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 AKAP14Q86UN6 197 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 CD28P10747 220 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 P2RY1P47900 373 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 MYOZ3Q8TDC0 251 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 LYL1P12980 280 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 C15orf32Q32M92 178 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 ST6GAL2Q96JF0 529 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 ATP5G2Q06055 141 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 ETV3LQ6ZN32 361 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFB8O95169 186 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 OPRK1P41145 380 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 Q5BKY6 102 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF491Q8N8L2 437 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf44Q8N8P7 122 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 DCUN1D4Q92564 292 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 CXorf58Q96LI9 332 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2E2Q96LR5 201 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 FAM24AA6NFZ4 105 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 DEFA5Q01523 94 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A31Q9H0C2 315 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 MT-CO2P00403 227 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 METTL15P1P0C7V9 234 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A4P12235 298 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 ETFRF1Q6IPR1 90 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 C12orf54Q6X4T0 127 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 STX12Q86Y82 276 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 VN1R17PQ8TDU5 208 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-201ENST00000345425 I3L2K1 104 aa21.58■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 K7EIM0 57 aa21.58■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP10-3P60369 221 aa21.58■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 TCTE3Q8IZS6 198 aa21.58■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM252Q8N6L7 170 aa21.58■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 OR10P1Q8NGE3 313 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 G3V3Q6 166 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 OR8G2PQ6IF36 304 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 SCARB1Q8WTV0 552 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 MFSD2BA6NFX1 497 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 SMLR1H3BR10 107 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 SULT1A1P50225 295 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 CD69Q07108 199 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 IGSF23A1L1A6 192 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 PMS2P5A8MQ11 134 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 CACNG8Q8WXS5 425 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 CITED1Q99966 193 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV3-11P01762 117 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 BAXQ07812 192 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 FAM209BQ5JX69 171 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 C3orf56Q8N813 242 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 C21orf62Q9NYP8 219 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS46E5RG02 174 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 CST7O76096 145 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 RPL12P30050 165 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 SLC16A13Q7RTY0 426 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF546Q86UE3 836 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF747Q9BV97 191 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 HBG1P69891 147 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 HBG2P69892 147 aa21.53■■□□□ 1.04
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