RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 GOSR2O14653 212 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN15O95858 294 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 NPY1RP25929 384 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf87Q6NUJ2 197 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 NOXA1Q86UR1 476 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 OR5B12Q96R08 314 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 MAGT1Q9H0U3 335 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 GSKIPQ9P0R6 139 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 MFSD2BA6NFX1 497 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 I3L2K1 104 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 WRBO00258 174 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 IAPPP10997 89 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 MYCNOSP40205 109 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB136Q30KP8 78 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 RAX2Q96IS3 184 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC140Q96MF4 163 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6V0BQ99437 205 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 NMES1Q9C002 83 aa10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 CCL24O00175 119 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SIX6O95475 246 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SCGB1D2O95969 90 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 MT-CO2P00403 227 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA10P01566 189 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 H2BFSP57053 126 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF616Q08AN1 781 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PRR31Q5SQ13 230 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OR11H1Q8NG94 326 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SCARB1Q8WTV0 552 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 MISP3Q96FF7 219 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RAB40CQ96S21 281 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 MGAT4CQ9UBM8 478 aa10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 A0A087WW49 117 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 C15orf62A8K5M9 175 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 K7EPK0 472 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SSSCA1O60232 199 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PF4P02776 101 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R30P59541 319 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OR1N2Q8NGR9 330 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM8Q96KF7 97 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 MED28Q9H204 178 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 C21orf62Q9NYP8 219 aa10.2□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 VWFP04275 2813 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 F8W735 103 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01619G3V211 115 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM50AO95807 157 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV12-3P01733 135 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OR8U8P0C7N1 319 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PAX9P55771 341 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RPP30P78346 268 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RAB32Q13637 225 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00482Q8N8I6 264 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 DUX3Q96PT4 197 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TXN2Q99757 166 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf1Q9H5F2 150 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 S4R3C0 116 aa10.19□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 TSC22D2O75157 780 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-23P01764 117 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 CXCL3P19876 107 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 ZP3P21754 424 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OPRK1P41145 380 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 RAB11AP62491 216 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 FCN2Q15485 313 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OR11H7Q8NGC8 314 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 DPF1Q92782 380 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 OR4C12Q96R67 309 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 PSENENQ9NZ42 101 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 NOTCH3Q9UM47 2321 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 H3BP45 60 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 BMPR1BO00238 502 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA4P05014 189 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC3BP05452 202 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A4P12235 298 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 GPR183P32249 361 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 MFAP4P55083 255 aa10.17□□□□□ -0.78
CCDC42-201ENST00000293845 S100A10P60903 97 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms