RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293068.9

IKZF3-201, Transcript of IKAROS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IKZF3, Length 2,224 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3-201ENST00000293068 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 AREGP15514 252 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 SUN5Q8TC36 379 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 MANBALQ9NQG1 85 aa8.53□□□□□ -1.04
IKZF3-201ENST00000293068 NPFFO15130 113 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 LINC00869P0C866 280 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FAM106CPP0CH98 169 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 TMEM11P17152 192 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CD24P25063 80 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 PAX6P26367 422 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 OR10J1P30954 320 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 BRS3P32247 399 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 PSMB3P49720 205 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 RHOBP62745 196 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 Q8N6K4 173 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 ACY3Q96HD9 319 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SLC25A16P16260 332 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SAA4P35542 130 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 NPBWR1P48145 328 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 MISP3Q96FF7 219 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 C1RLQ9NZP8 487 aa8.52□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 MT-CO2P00403 227 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CRYGCP07315 174 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FXYD3Q14802 87 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 THAP8Q8NA92 274 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 NRGNQ92686 78 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 AJUBAQ96IF1 538 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.51□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CXorf1O96002 111 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FBP1P09467 338 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 STAG3L2P0CL84 134 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 STAG3L3P0CL85 134 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 DEFA4P12838 97 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CEBPGP53567 150 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 NANPQ8TBE9 248 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 NPIPB3Q92617 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 APELAP0DMC3 54 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 MFAP2P55001 183 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 AKAP6Q13023 2319 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FAM74A7A6NL05 159 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 M0R036 132 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 IGHV1-69P01742 117 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 MSMBP08118 114 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 RND2P52198 227 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SELENOTP62341 195 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FBLN7Q53RD9 439 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 RNF2Q99496 336 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 B4DSR2 109 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CTRB1P17538 263 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 RHEBQ15382 184 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 AWAT1Q58HT5 328 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 ARPC1AQ92747 370 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 FUT9Q9Y231 359 aa8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 TMEM250H0YL14 139 aa8.48□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 H3BQ15 152 aa8.48□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 PAGE4O60829 102 aa8.48□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.48□□□□□ -1.05
IKZF3-201ENST00000293068 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms