RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM219Q86XT9 240 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.88□□□□□ -0.83
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CFDP1-201ENST00000283882 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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CFDP1-201ENST00000283882 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.86□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.86□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
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CFDP1-201ENST00000283882 PARP11Q9NR21 331 aa9.85□□□□□ -0.83
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CFDP1-201ENST00000283882 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.85□□□□□ -0.83
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CFDP1-201ENST00000283882 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.84□□□□□ -0.83
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CFDP1-201ENST00000283882 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.84□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.84□□□□□ -0.83
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CFDP1-201ENST00000283882 SMCO3A2RU48 225 aa9.82□□□□□ -0.84
CFDP1-201ENST00000283882 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.82□□□□□ -0.84
CFDP1-201ENST00000283882 I3L2K1 104 aa9.82□□□□□ -0.84
CFDP1-201ENST00000283882 DEFA4P12838 97 aa9.82□□□□□ -0.84
CFDP1-201ENST00000283882 RAB14P61106 215 aa9.82□□□□□ -0.84
CFDP1-201ENST00000283882 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CFDP1-201ENST00000283882 AKR1C1Q04828 323 aa9.82□□□□□ -0.84
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