RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 WNT2P09544 360 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A16P16260 332 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01560Q8TB33 94 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 USMG5Q96IX5 58 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 FBXL15Q9H469 300 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 C1QL1O75973 258 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 GLRX5Q86SX6 157 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 RNF125Q96EQ8 232 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 GBF1Q92538 1859 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TSC2P49815 1807 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV1-46P01743 117 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PRSS2P07478 247 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 Q8TCH9 128 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 CGAP01215 116 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 J3KRW8 73 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 NAPSAO96009 420 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TSKUQ8WUA8 353 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 FOXL1Q12952 345 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 ST20Q9HBF5 79 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 DEPPQ9NTK1 212 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MGAMO43451 1857 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 H3BVH4 76 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 GFI1Q99684 422 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 REG1AP05451 166 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MYO10Q9HD67 2058 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 FOXL2P58012 376 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PLP1P60201 277 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM178BH3BS89 294 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 RHOGP84095 191 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 NMSQ5H8A3 153 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 DUX3Q96PT4 197 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0A6YYD4 124 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PLAUP00749 431 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TYMSP04818 313 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 QRFPP83859 136 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 LY6EQ16553 131 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 LEAP2Q969E1 77 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MSGN1A6NI15 193 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 BMPERQ8N8U9 685 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 HBDP02042 147 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 RLFQ13129 1914 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.49□□□□□ -1.21
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