RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ARL3P36405 182 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 ZNF414Q96IQ9 312 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 PDCD10Q9BUL8 212 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SORL1Q92673 2214 aa16.98■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 TCRBP04435 133 aa16.97■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 DHRS2Q13268 280 aa16.97■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 SMCO1Q147U7 214 aa16.97■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 GPHB5Q86YW7 130 aa16.97■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.97■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GU03 582 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 K7EIL1 84 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 UPK1BO75841 260 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 GPR183P32249 361 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 REC114Q7Z4M0 266 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 TMEM170AQ8WVE7 144 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 MISP3Q96FF7 219 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 C21orf62Q9NYP8 219 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 HSPB7Q9UBY9 170 aa16.96■□□□□ 0.31
SYF2-201ENST00000236273 NXPH3O95157 252 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 MT-CO2P00403 227 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 EDN2P20800 178 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ASAH1Q13510 395 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 LYG2Q86SG7 212 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0BQ99437 205 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 CHRDL1Q9BU40 450 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 C20orf85Q9H1P6 137 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa16.96■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 OR2T8A6NH00 312 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 LGALS9O00182 355 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TGOLN2O43493 480 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 IGLV1-51P01701 117 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-48P01763 117 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A6P12236 298 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ADMP35318 185 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 SNCAP37840 140 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF9Q07011 255 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TATDN3Q17R31 274 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 OR4C12Q96R67 309 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ELOVL1Q9BW60 279 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16.95■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 CTSGP08311 255 aa16.94■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 HOXB5P09067 269 aa16.94■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 MLANAQ16655 118 aa16.94■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 GGNBP1Q5YKI7 109 aa16.94■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ENY2Q9NPA8 101 aa16.94■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 CEBPZOSA8MTT3 80 aa16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ADAP1O75689 374 aa16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 PLET1Q6UQ28 207 aa16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 OR52B4Q8NGK2 314 aa16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 RBKSQ9H477 322 aa16.93■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TRAV6A0A075B6T7 132 aa16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 MPTX1A8MV57 137 aa16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 29.2
SYF2-201ENST00000236273 C2orf83Q53S99 150 aa16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 PRR25Q96S07 402 aa16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 CACFD1Q9UGQ2 172 aa16.92■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TGP01266 2768 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 SPNP16150 400 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 HTR2BP41595 481 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 MFAP4P55083 255 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 C4orf46Q504U0 113 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 SPSB3Q6PJ21 355 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 OR1S1Q8NH92 325 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 MRAPQ8TCY5 172 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 MITD1Q8WV92 249 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TXN2Q99757 166 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 NUDT15Q9NV35 164 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 PEMTQ9UBM1 199 aa16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 TMEM213A2RRL7 107 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 C2orf70A6NJV1 201 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 FAM106AQ4KMX7 169 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 Q56UQ5 140 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 UBAC2Q8NBM4 344 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 COQ8AQ8NI60 647 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 DTD1Q8TEA8 209 aa16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 DNAH9Q9NYC9 4486 aa16.89■□□□□ 0.3
SYF2-201ENST00000236273 A8MWP6 167 aa16.89■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 SLC24A4Q8NFF2 622 aa16.89■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 ZNF320A2RRD8 509 aa16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 CORTO00230 105 aa16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 FOLR2P14207 255 aa16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 TM4SF20Q53R12 229 aa16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms