RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 HLA-DMBP28068 263 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 TALDO1P37837 337 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 OR10A3P58181 314 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 Q6ZTC4 211 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 UFD1Q92890 307 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 HRH4Q9H3N8 390 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 THYN1Q9P016 225 aa6.34□□□□□ -1.39
TTR-204ENST00000610404 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 C15orf62A8K5M9 175 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 PTGES3LE9PB15 166 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 M0R2N4 97 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 UPK2O00526 184 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CHEK1O14757 476 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 ARL6IP5O75915 188 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SLC22A5O76082 557 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 DTYMKP23919 212 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 FABP5Q01469 135 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 WT1-ASQ06250 92 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TMEM187Q14656 261 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 ZNF773Q6PK81 442 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CENPOQ9BU64 300 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.33□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 PKD1P98161 4303 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 C15orf61A6NNL5 157 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 K7EIM0 57 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SERPINE2P07093 398 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CTXN2P0C2S0 81 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 HSMCR30P0CW71 290 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 OR13C7P0DN81 318 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SSX1Q16384 188 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CDNFQ49AH0 187 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 LEMD1Q68G75 181 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.32□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 HSPG2P98160 4391 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 AGRNO00468 2067 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 IFITM5A6NNB3 132 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CTSGP08311 255 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 PTHLHP12272 177 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TAS2R31P59538 309 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 DEFB131AP59861 70 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 POU2AF1Q16633 256 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 Q56UQ5 140 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 HACD4Q5VWC8 232 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CNIH2Q6PI25 160 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 OR10C1Q96KK4 312 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 RNF126Q9BV68 326 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TMEM140Q9NV12 185 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 CELA1Q9UNI1 258 aa6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TMEM235A6NFC5 223 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SULT1C2O00338 296 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 SSX5O60225 188 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 AMBPP02760 352 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 NQO2P16083 231 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 C4BPBP20851 252 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 RANBP1P43487 201 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TRAM1Q15629 374 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 TCF24Q7RTU0 167 aa6.3□□□□□ -1.4
TTR-204ENST00000610404 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.3□□□□□ -1.4
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