RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MED6O75586 246 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFSF13O75888 250 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CGAP01215 116 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CRYGCP07315 174 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 VDAC1P21796 283 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 F2RP25116 425 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CD1BP29016 333 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CD200P41217 278 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SULT1A2P50226 295 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 PSG7Q13046 419 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF266Q14584 549 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 HMGN3Q15651 99 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR31Q8NA23 367 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM57AQ8TBR7 257 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 C17orf50Q8WW18 174 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MARC2Q969Z3 335 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 STARD4Q96DR4 205 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf85Q96MD7 179 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF2Q99496 336 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 HES4Q9HCC6 221 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNG5Q9UF02 275 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF24Q9Y225 148 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ITPR1Q14643 2758 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GU03 582 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R1B8 84 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SSSCA1O60232 199 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 PITX3O75364 302 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SCO1O75880 301 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2J3O76001 311 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG12O94817 140 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 APOC3P02656 99 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 AMBPP02760 352 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINE2P07093 398 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC11BP0C7V7 166 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A6P12236 298 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IL2RGP31785 369 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 BMI1P35226 326 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRA2P47869 451 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB5CP51148 216 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 FABP6P51161 128 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF83P51522 516 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 CAV2P51636 162 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 AKR1C2P52895 323 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM33P57088 247 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 BAXQ07812 192 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 CATR1Q13166 79 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 MSMO1Q15800 293 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IGFBP7Q16270 282 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 NMSQ5H8A3 153 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR82Q6UXN9 313 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SSX9Q7RTT3 188 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 MTURNQ8N3F0 131 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51H1Q8NH63 302 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC29Q8WV35 223 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
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