RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX22C9J3V5 150 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13C7P0DN81 318 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TPT1P13693 172 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TUSC1Q2TAM9 212 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 C22orf15Q8WYQ4 148 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5SQ99766 215 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SVEP1Q4LDE5 3571 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FOSL1P15407 271 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SRP14P37108 136 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 IFITM2Q01629 132 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC38A11Q08AI6 406 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB2A2Q13296 93 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8G2PQ6IF36 304 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ETV3LQ6ZN32 361 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 HAPLN4Q86UW8 402 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM219Q86XT9 240 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 GGACTQ9BVM4 153 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ACANP16112 2415 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX261Q6UWH6 196 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 LILRB2Q8N423 598 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SSMEM1Q8WWF3 244 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ST8SIA2Q92186 375 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA4P05014 189 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL16Q0P5N6 197 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM170AQ8WVE7 144 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CLINT1Q14677 625 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6EQ16553 131 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 BAP18Q8IXM2 172 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 PHYHIPLQ96FC7 376 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC1Q9HC57 220 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 BAHCC1Q9P281 2608 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS13O14921 159 aa24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA7P01567 189 aa24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD5Q8WTS1 349 aa24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS46E5RG02 174 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN9O75954 239 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-59P01825 116 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF767PQ75MW2 155 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1L6Q8NGR2 347 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM68Q96MH6 324 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RX4Q99571 388 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC10F2Z333 226 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 DLK1P80370 383 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PVRIGQ6DKI7 326 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1P1Q8NH06 330 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM147Q9BVK8 224 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ARV1Q9H2C2 271 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 VPREB3Q9UKI3 123 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CORTO00230 105 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA5P01569 189 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 AMY1AP04745 511 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 AREGP15514 252 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 VWC2Q2TAL6 325 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SGMS2Q8NHU3 365 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TMUB1Q9BVT8 246 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 NDPQ00604 133 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM86BQ8N661 226 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF680Q8NEM1 530 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 UQCC1Q9NVA1 299 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPB5A8MRT5 1133 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYGCP07315 174 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CTRB1P17538 263 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CTRB2Q6GPI1 263 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17RELQ6ZVW7 336 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPB9Q9BQS6 159 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNG8Q8WXS5 425 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 GINS3Q9BRX5 216 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CFDP00746 253 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CD99P14209 185 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC9CQ8N5M4 171 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5BO43169 146 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 REG1AP05451 166 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A24Q6NUK1 477 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6G6DO95868 133 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB1C1Q8TD33 95 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP11Q9NR21 331 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 UBQLN2Q9UHD9 624 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 OTOGQ6ZRI0 2925 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHG2P01859 326 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CD69Q07108 199 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 AKIRIN2Q53H80 203 aa24.49■■□□□ 1.51
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