RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580949.1

PTPRM-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-213	ENST00000580949	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	RPE	Q96AT9	228 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	FCN1	O00602	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	SLC25A17	O43808	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	VENTX	O95231	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	SPP1	P10451	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	RAB13	P51153	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	UBE2E1	P51965	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	F2RL1	P55085	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	RAB14	P61106	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	RUNX1	Q01196	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	FHL2	Q14192	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	HNF4G	Q14541	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	SSX2	Q16385	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	PRSS8	Q16651	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	STX12	Q86Y82	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	ATP5S	Q99766	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-213	ENST00000580949	TNC	P24821	2201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CA2	P00918	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SLPI	P03973	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CD1B	P29016	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CEACAM3	P40198	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SULT1A2	P50226	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949		Q8N6K4	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	NPFF	O15130	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	DFFB	O76075	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MOS	P00540	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IFNA10	P01566	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MSMB	P08118	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FGF2	P09038	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.5 ms