RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RAMP3O60896 148 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GLRXP35754 106 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 OR4A5Q8NH83 315 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PLXNA2O75051 1894 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ST20Q9HBF5 79 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 F5H697 171 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SCN5AQ14524 2016 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 DNAJC13O75165 2243 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 HIGD1CA8MV81 97 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TREML4Q6UXN2 200 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 LEAP2Q969E1 77 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 NEU1Q99519 415 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MPDZO75970 2070 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PSMB2P49721 201 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 FBLN7Q53RD9 439 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0G2JMM0 328 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPB8 328 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PRS3 328 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 RAB9AP51151 201 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 RFNGQ9Y644 331 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 C5orf63A6NC05 138 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 UPK2O00526 184 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 SMIM13P0DJ93 91 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 HGFACQ04756 655 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TYMSP04818 313 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MFAP4P55083 255 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 CECR9P0C854 216 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 APELAP0DMC3 54 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 RAB37Q96AX2 223 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 CELA3AP09093 270 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.66□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 DLX1P56177 255 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 DEFB123Q8N688 67 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TDGF1P3P51864 188 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PRCDQ00LT1 54 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GGNQ86UU5 652 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 PRR7Q8TB68 274 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 TSKUQ8WUA8 353 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 OR9G9P0C7N8 305 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GPR183P32249 361 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 SGK494Q96LW2 274 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRM-205ENST00000577827 AREGP15514 252 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 NEUROG1Q92886 237 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 HIST1H4GQ99525 98 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 MED12Q93074 2177 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-205ENST00000577827 GDF9O60383 454 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 SPEM2Q0P670 501 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 WDR82Q6UXN9 313 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 LOXL4Q96JB6 756 aa8.65□□□□□ -1.03
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