RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	ARL3	P36405	182 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	DHODH	Q02127	395 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256		S4R3C0	116 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ATG13-223	ENST00000577256	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	CDS2	O95674	445 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SPN	P16150	400 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	OR2C1	O95371	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	CSN3	P07498	182 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256		A0A0B4J293	547 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	LGALS9	O00182	355 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	CLEC3B	P05452	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	GP9	P14770	177 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	MFAP2	P55001	183 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SRR	Q9GZT4	340 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	GPR183	P32249	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	IFNA17	P01571	189 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	CD69	Q07108	199 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256		K7EIM0	57 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	TGOLN2	O43493	480 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	ANXA3	P12429	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	AKR1C4	P17516	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	INPP1	P49441	399 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM187	Q14656	261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ATG13-223	ENST00000577256	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	SNCA	P37840	140 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256		A8MWP6	167 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	SPCS3	P61009	180 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	SRPX	P78539	464 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256		Q6ZRM9	215 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATG13-223	ENST00000577256	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.38	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms