RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	CMC2	Q9NRP2	79 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	COA4	Q9NYJ1	87 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	EHF	Q9NZC4	300 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC182	A6NF36	153 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2J3	O76001	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	GADD45G	O95257	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	T-ENOL	P0DO92	83 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	GNB3	P16520	340 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	FUT3	P21217	361 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	PRKACB	P22694	351 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	NUDT2	P50583	147 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	CRISP1	P54107	249 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	KRTAP10-1	P60331	282 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	RAB11A	P62491	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	RHOG	P84095	191 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP5G2	Q06055	141 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MED21	Q13503	144 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	PSG5	Q15238	335 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	RAB11B	Q15907	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MICA	Q29983	383 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MORN2	Q502X0	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	OR1L1	Q8NH94	360 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MITD1	Q8WV92	249 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	CLCC1	Q96S66	551 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	PARL	Q9H300	379 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SPATA2	Q9UM82	520 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234		R4GMQ9	66 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT36	O76013	467 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	IFNA5	P01569	189 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	HSD17B1	P14061	328 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SRPX	P78539	464 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	COQ5	Q5HYK3	327 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM80	Q96HE8	168 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	EBF4	Q9BQW3	602 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MUC2	Q02817	5179 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TNXB	P22105	4242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1B0GW64	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TRDC	B7Z8K6	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234		H0YJW9	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ATF1	P18846	271 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SERPINA2	P20848	420 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ASIP	P42127	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	BCAP31	P51572	246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TRIM16L	Q309B1	348 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF2	Q99496	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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