RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564726.5

RBBP6-208, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, human

TSL 3

Gene RBBP6, Length 514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP6-208	ENST00000564726	BATF	Q16520	125 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		Q6ZQT0	140 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	AAED1	Q7RTV5	226 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	TMEM106A	Q96A25	262 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CNBD2	Q96M20	576 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	DCC	P43146	1447 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ABCC11	Q96J66	1382 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	C2orf70	A6NJV1	201 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		M0QX08	132 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CXCR6	O00574	342 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ACOX3	O15254	700 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	OR5F1	O95221	314 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	IGKV1-5	P01602	117 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CRYGA	P11844	174 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	MARCKSL1	P49006	195 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	NAA20	P61599	178 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CAV1	Q03135	178 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	MED21	Q13503	144 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		Q8N6K4	173 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	OR2T4	Q8NH00	348 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	PFN4	Q8NHR9	129 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	KLK6	Q92876	244 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	DERL1	Q9BUN8	251 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	C3orf18	Q9UK00	162 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	MCM3AP	O60318	1980 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	FUOM	A2VDF0	154 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HTR1A	P08908	422 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	SPI1	P17947	270 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	BRS3	P32247	399 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	STX5	Q13190	355 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	PDE6H	Q13956	83 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	COQ5	Q5HYK3	327 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	LINC00311	Q8N616	119 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	PIGX	Q8TBF5	258 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	OR51I1	Q9H343	314 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	APC	P25054	2843 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		H0Y980	276 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		M0QZ92	97 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	OR2T1	O43869	369 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	ADGRB2	O60241	1585 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	OR1I1	O60431	355 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	UCHL3	P15374	230 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	MYL12A	P19105	171 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	GRK1	Q15835	563 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		Q6ZS49	121 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	LINC00471	Q8N535	108 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		Q8N814	137 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	RAB8B	Q92930	207 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CKLF	Q9UBR5	152 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	TOPBP1	Q92547	1522 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	PEAK1	Q9H792	1746 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726		M0R2N4	97 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HYPM	O75409	117 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	MIF	P14174	115 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HIST1H2BO	P23527	126 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HIST1H2BB	P33778	126 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HIST1H2BD	P58876	126 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	RAB4B	P61018	213 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	RAB5B	P61020	215 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HIST1H2BC	P62807	126 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	IFITM2	Q01629	132 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	PMAIP1	Q13794	54 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
RBBP6-208	ENST00000564726	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		0.16	□□□□□ -2.38

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