RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561300.1

TMOD2-205, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD2, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-205ENST00000561300 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 HES1Q14469 280 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 MMDQ15546 238 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 BRMS1LQ5PSV4 323 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SAMD13Q5VXD3 122 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 OOSP2Q86WS3 158 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 C20orf196Q8IYI0 205 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 C1orf174Q8IYL3 243 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 C1orf158Q8N1D5 194 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF439Q8NDP4 499 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 OR8B12Q8NGG6 310 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 OR5J2Q8NH18 312 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 OR10A6Q8NH74 314 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SLC25A40Q8TBP6 338 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CT55Q8WUE5 264 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 C11orf40Q8WZ69 217 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ROPN1LQ96C74 230 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 MS4A6EQ96DS6 147 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CNBD2Q96M20 576 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 NMNAT3Q96T66 252 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 AICDAQ9GZX7 198 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM222Q9H0R3 208 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SLC23A2Q9UGH3 650 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 PRNDQ9UKY0 176 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SNX12Q9UMY4 172 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SSR3Q9UNL2 185 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 COQ4Q9Y3A0 265 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SCN8AQ9UQD0 1980 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 RTL1A6NKG5 1358 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 DENND4CQ5VZ89 1909 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 FANCMQ8IYD8 2048 aa0.93□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 NUP160Q12769 1436 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 A0A1W2PRE2 83 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 IGSF23A1L1A6 192 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 H3BRN7 92 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 H3BSA7 217 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 H7C1C5 153 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 PIRO00625 290 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 COX7A2LO14548 114 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 UBE2L6O14933 153 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CST8O60676 142 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 NDUFC2O95298 119 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 APOMO95445 188 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 C1QBP02746 253 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 PPBPP02775 128 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CD7P09564 240 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SCGB1A1P11684 91 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CDK2P24941 298 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ATP6V0CP27449 155 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 AKR1C3P42330 323 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CA7P43166 264 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 GABRA4P48169 554 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 LCN6P62502 163 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 GNA12Q03113 381 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 GRK1Q15835 563 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SMIM21Q3B7S5 101 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM78Q5T7P6 136 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 Q6ZS49 121 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 GDPD1Q8N9F7 314 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 OR11H6Q8NGC7 330 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CD200R1Q8TD46 325 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 RAB2BQ8WUD1 216 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ACOT12Q8WYK0 555 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 HIST1H2BAQ96A08 127 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CMBLQ96DG6 245 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 DNAJC30Q96LL9 226 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CCL13Q99616 98 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 VPS25Q9BRG1 176 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 EFCAB11Q9BUY7 163 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CCDC32Q9BV29 185 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 COMMD5Q9GZQ3 224 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ACER3Q9NUN7 267 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 CYSLTR1Q9Y271 337 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 ASB4Q9Y574 426 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 STRCP1A6NGW2 1772 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 TRPM6Q9BX84 2022 aa0.92□□□□□ -2.26
TMOD2-205ENST00000561300 RFX7Q2KHR2 1363 aa0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms