RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561096.5

MEIS3-210, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,883 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-210ENST00000561096 APOC3P02656 99 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 ATP5J2P56134 94 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 RAB2AP61019 212 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 CTAG1AP78358 180 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 HNF4GQ14541 408 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 PRSS8Q16651 343 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 ZNF787Q6DD87 383 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 SSX7Q7RTT5 188 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 MMD2Q8IY49 270 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 FAM168AQ92567 244 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 PERPQ96FX8 193 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 C1orf159Q96HA4 380 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 SMCO3A2RU48 225 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 WT1-ASQ06250 92 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 ZNF709Q8N972 641 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 SEC11CQ9BY50 192 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 MBP02144 154 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 MAS1LP35410 378 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 PEA15Q15121 130 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 MINOS1Q5TGZ0 78 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 TBX15Q96SF7 602 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 MGST2Q99735 147 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 OOSP1A8MZH6 123 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 F8W036 122 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 SOX15O60248 233 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 SFTA3P0C7M3 94 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 PAX1P15863 534 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 ERHP84090 104 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 LINC00518Q8N0U6 118 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 FASNP49327 2511 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 A0A1W2PRD5 423 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 A0A1W2PRF3 423 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 A0A1W2PRM7 423 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 TOX4O94842 621 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 OPRK1P41145 380 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-210ENST00000561096 COMPP49747 757 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 GUCA2BQ16661 112 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 TEPPQ6URK8 271 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 LCN15Q6UWW0 184 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 FBXL15Q9H469 300 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 NDUFA3O95167 84 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 PPT1P50897 306 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 UBE2E1P51965 193 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 DEFA5Q01523 94 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 CD69Q07108 199 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 TNXAQ16473 311 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 NPBQ8NG41 125 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 P2RX4Q99571 388 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 RARRES2Q99969 163 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 ZANQ9Y493 2812 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 YIF1AO95070 293 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 MOSP00540 346 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 OR13C7P0DN81 318 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 PAX6P26367 422 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 SSX2Q16385 188 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 TMEM144Q7Z5S9 345 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 SVBPQ8N300 66 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 ZNF114Q8NC26 417 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 SLC25A22Q9H936 323 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-210ENST00000561096 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms