RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
USP3-AS1-203ENST00000559737 MS4A10Q96PG2 267 aa14.58□□□□□ -0.07
USP3-AS1-203ENST00000559737 NMES1Q9C002 83 aa14.58□□□□□ -0.07
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.58□□□□□ -0.07
USP3-AS1-203ENST00000559737 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 WRBO00258 174 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 MED6O75586 246 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB32Q13637 225 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TEX38Q6PEX7 206 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 P2RX4Q99571 388 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLK15Q9H2R5 256 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 K7EPK0 472 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSSCA1O60232 199 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 PF4V1P10720 104 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMB8P28062 276 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFAP2P55001 183 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEFA5Q01523 94 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD28P10747 220 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEFA4P12838 97 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNCAP37840 140 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 S100A10P60903 97 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOXE3Q13461 319 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM50AO95807 157 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 ELANEP08246 267 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB9AP51151 201 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 BSXQ3C1V8 233 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 COMMD1Q8N668 190 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF114Q8NC26 417 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 MDFIQ99750 246 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 H3BUA1 57 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRGV3P03979 118 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAX9P55771 341 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TPPP2P59282 170 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF152Q8N8N0 203 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR1P1Q8NH06 330 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 H3BP45 60 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR2J3O76001 311 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRI3O95415 125 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFNA10P01566 189 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 HTR2BP41595 481 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLK9Q2XQG4 91 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM65Q6PI78 240 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 STAB1Q9NY15 2570 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 H0YIZ8 118 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 NDUFB8O95169 186 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPY1RP25929 384 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RHOGP84095 191 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD83Q01151 205 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 C2orf83Q53S99 150 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM8Q96KF7 97 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB40CQ96S21 281 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSENENQ9NZ42 101 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 U3KQ87 197 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-203ENST00000559737 C15orf62A8K5M9 175 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEDDO75618 318 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 MPC2O95563 127 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 MISP3Q96FF7 219 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR4C12Q96R67 309 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 L7N2F9 121 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-203ENST00000559737 BCAP31P51572 246 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.3 ms