RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM251Q8N6I4 163 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 YIPF7Q8N8F6 280 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR11G2Q8NGC1 345 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR13C4Q8NGS5 318 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ZNRF2Q8NHG8 242 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 C10orf82Q8WW14 230 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 MALSU1Q96EH3 234 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 RBP7Q96R05 134 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR7D2Q96RA2 312 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR52B2Q96RD2 323 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR52E6Q96RD3 313 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TRIB3Q96RU7 358 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 S100A13Q99584 98 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 PKMYT1Q99640 499 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 REG4Q9BYZ8 158 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ARL6Q9H0F7 186 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ABCG5Q9H222 651 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF286AQ9HBT8 521 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 KCNIP2Q9NS61 270 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SPANXCQ9NY87 97 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 VPS29Q9UBQ0 182 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 HHLA2Q9UM44 414 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TOP2BQ02880 1626 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ABCA9Q8IUA7 1624 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TRPM6Q9BX84 2022 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 KDM5CP41229 1560 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 EFCAB5A4FU69 1503 aa1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 PREX2Q70Z35 1606 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 MYH7P12883 1935 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 A0A1B0GU33 70 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 IGSF23A1L1A6 192 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 M0R233 179 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 AZIN1O14977 448 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SLC31A1O15431 190 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CNIH1O95406 144 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 IFNA1P01562 189 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 IGKV1D-12P01611 117 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 MT-ND4LP03901 98 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TYMSP04818 313 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ISG15P05161 165 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SERPINA7P05543 415 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CST2P09228 141 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SMIM17P0DL12 118 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CD79AP11912 226 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 MYL12AP19105 171 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CMPK1P30085 196 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ARPP19P56211 112 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CLDN12P56749 244 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TCTAP57738 103 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 GABARAPL2P60520 117 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CKS1BP61024 79 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CDK6Q00534 326 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 DEFA5Q01523 94 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 RHEBQ15382 184 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 NEDD8Q15843 81 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CLEC12BQ2HXU8 276 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TBC1D28Q2M2D7 210 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 MORN2Q502X0 79 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 FAM74A1Q5RGS3 127 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 C10orf91Q5T1B1 145 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TOMM20LQ6UXN7 152 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF720Q7Z2F6 126 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB128Q7Z7B8 93 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 LRP11Q86VZ4 500 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR6V1Q8N148 313 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 Q8NAQ8 132 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 LY6G5BQ8NDX9 201 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR52E4Q8NGH9 312 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR8D4Q8NGM9 314 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR13C8Q8NGS7 320 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 OR2T4Q8NH00 348 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SPPL2BQ8TCT7 592 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TVP23CQ96ET8 276 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 PBDC1Q9BVG4 233 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SNHG12Q9BXW3 62 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CST9LQ9H4G1 147 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 TUBA4BQ9H853 241 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SMCO4Q9NRQ5 59 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 FBXL12Q9NXK8 326 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 SLC23A2Q9UGH3 650 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-205ENST00000558714 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms