RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PRSS54Q6PEW0 395 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 DOLPP1Q86YN1 238 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NPWQ8N729 165 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CDRT4Q8N9R6 151 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR4K5Q8NGD3 323 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR1J4Q8NGS1 313 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR1P1Q8NH06 330 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CANT1Q8WVQ1 401 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GALMQ96C23 342 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SEH1LQ96EE3 360 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF799Q96GE5 643 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CYYR1Q96J86 154 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ZFP3Q96NJ6 502 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 HIST1H2BLQ99880 126 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF649Q9BS31 505 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LINC00470Q9BZP3 86 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 C20orf27Q9GZN8 174 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ARL6Q9H0F7 186 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR51E2Q9H255 320 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LRTM1Q9HBL6 345 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 UQCC1Q9NVA1 299 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF226Q9NYT6 803 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NAT8Q9UHE5 227 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 UNC13CQ8NB66 2214 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 BSNQ9UPA5 3926 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 A0A087X0T9 212 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1B0GTI1 187 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 G3V3Q6 166 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CLDN34H7C241 214 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 UPK1AO00322 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 EEDO75530 441 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ETHE1O95571 254 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 AIFM1O95831 613 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SOD1P00441 154 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 IFNA1P01562 189 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 IGLV2-23P01705 113 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OPN1SWP03999 348 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MPC1LP0DKB6 136 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CMPK1P30085 196 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR10J1P30954 320 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SDC2P34741 201 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GABRA2P47869 451 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NMUP48645 174 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SPINT3P49223 89 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CTBP2P56545 445 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 RAB38P57729 211 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TAS2R30P59541 319 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LCN2P80188 198 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CDK5Q00535 292 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PRSS8Q16651 343 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CEACAM21Q3KPI0 293 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CCSMST1Q4G0I0 132 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LCN8Q6JVE9 175 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 HEPN1Q6WQI6 88 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM183AQ8IXX5 376 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SYS1Q8N2H4 156 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GPR26Q8NDV2 337 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MDS2Q8NDY4 140 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR52L1Q8NGH7 329 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR52E4Q8NGH9 312 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 DIRAS2Q96HU8 199 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 COX14Q96I36 57 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CCDC115Q96NT0 180 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GPR82Q96P67 336 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TXNIPQ9H3M7 391 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 BEX1Q9HBH7 125 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM27Q9HBJ8 222 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CLN8Q9UBY8 286 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 RFNGQ9Y644 331 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CACNA1DQ01668 2161 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ESPL1Q14674 2120 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CENPEQ02224 2701 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LRBAP50851 2863 aa2.98□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms