RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CACNG5Q9UF02 275 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C9orf170A2RU37 121 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR2J3O76001 311 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TCRBP04435 133 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR4E1P0C645 316 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFA5Q01523 94 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP5G2Q06055 141 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C15orf32Q32M92 178 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NMSQ5H8A3 153 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM209BQ5JX69 171 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6ZRM9 215 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF114Q8NC26 417 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR52E5Q8NH55 327 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPR146Q96CH1 333 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 THYN1Q9P016 225 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A087WW49 117 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC01619G3V211 115 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFNA17P01571 189 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFITM3Q01628 133 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DHRS2Q13268 280 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C4orf46Q504U0 113 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LYG2Q86SG7 212 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR2C3Q8N628 320 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR1P1Q8NH06 330 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DPF1Q92782 380 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUDT15Q9NV35 164 aa9.95□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPCS3P61009 180 aa9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMCO1Q147U7 214 aa9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COQ8AQ8NI60 647 aa9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ENKURQ8TC29 256 aa9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CXorf58Q96LI9 332 aa9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.94□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1B0GU03 582 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NDUFB8O95169 186 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC25A6P12236 298 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZP3P21754 424 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFA1P59665 94 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFA3P59666 94 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPINK9Q5DT21 86 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ENY2Q9NPA8 101 aa9.93□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNCAP37840 140 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLURP1P55000 103 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MFAP2P55001 183 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MITD1Q8WV92 249 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.92□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PITX3O75364 302 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRBV12-3P01733 135 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HOXB5P09067 269 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLL1P15814 213 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TNFRSF9Q07011 255 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR1S1Q8NH92 325 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC140Q96MF4 163 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP6V0BQ99437 205 aa9.91□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.9□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.9□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 G3V4G9 280 aa9.9□□□□□ -0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BMPR1BO00238 502 aa9.9□□□□□ -0.82
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