RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 APOHP02749 345 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 HLA-DMBP28068 263 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 DEFB131AP59861 70 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 POU2AF1Q16633 256 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 Q6ZTC4 211 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ZNF767PQ75MW2 155 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TCF24Q7RTU0 167 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 LILRB2Q8N423 598 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 MUC4Q99102 2169 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 AGRNO00468 2067 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ERICH4A6NGS2 130 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 FAM90A2PQ658T7 463 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 MISP3Q96FF7 219 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 CMTM3Q96MX0 182 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-227ENST00000551441 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 DBX1A6NMT0 343 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 KRASP01116 189 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 G6PCP35575 357 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 LPAR6P43657 344 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 TCTAP57738 103 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 ERVK-16P61578 105 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 Q8NAQ8 132 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 NRG4Q8WWG1 115 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 ST8SIA2Q92186 375 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 MARCH11A6NNE9 402 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 NOTOA8MTQ0 251 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 RLN1P04808 185 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 HOGA1Q86XE5 327 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 C11orf94C9JXX5 98 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 ST8SIA3O43173 380 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 DFFBO76075 338 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 MED14OSP0DP75 135 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 GNRHRP30968 328 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 MSMO1Q15800 293 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 COMMD9Q9P000 198 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 RABAC1Q9UI14 185 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 C15orf61A6NNL5 157 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 KNCNA6PVL3 124 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 RTL8CO15255 209 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 SNAPC5O75971 98 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 MT-CO2P00403 227 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 MFAP4P55083 255 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 PAFAH1B2P68402 229 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 MXD1Q05195 221 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 STHQ8IWL8 128 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 OR10C1Q96KK4 312 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 CELA1Q9UNI1 258 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 I3L2K1 104 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 C4BPBP20851 252 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 HERV-K104P61576 105 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-227ENST00000551441 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.66□□□□□ -0.54
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