RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 FKBP11Q9NYL4 201 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ZP3P21754 424 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 COMMD1Q8N668 190 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 OR4A5Q8NH83 315 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SSMEM1Q8WWF3 244 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 LHX4Q969G2 390 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TCF19Q9Y242 345 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 WASHC3Q9Y3C0 194 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TENM3Q9P273 2699 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 C22orf46C9J442 243 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 OR2B8PP59922 312 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 Q6ZRG5 221 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 LILRB2Q8N423 598 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 OR10P1Q8NGE3 313 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 C15orf62A8K5M9 175 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SHOXO15266 292 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 IGKV1-16P04430 117 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 VWC2Q2TAL6 325 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 VSTM2AQ8TAG5 236 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 KBTBD11O94819 623 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 GGACTQ9BVM4 153 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 H7C2Y5 167 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 LGALS7P47929 136 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 CAMLGP49069 296 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SERF2P84101 59 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 Q8N7P7 452 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 OR11H6Q8NGC7 330 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 OR5B3Q8NH48 314 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 HARBI1Q96MB7 349 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 C16orf95Q9H693 158 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDSP2-204ENST00000548823 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 HRH4Q9H3N8 390 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 OR51B2Q9Y5P1 312 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 COL7A1Q02388 2944 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 INS-IGF2F8WCM5 200 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 LY6LH3BQJ8 138 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 PRH1P02810 166 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 RAB11AP62491 216 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 PRCDQ00LT1 54 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 OR8G2PQ6IF36 304 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 Q6ZSV7 163 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 LFNGQ8NES3 379 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 ENY2Q9NPA8 101 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAH3Q8TD57 4116 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SOX15O60248 233 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 REG1BP48304 166 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 RUNX1Q01196 453 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC28AQ8IWP9 274 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF5Q99942 180 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 KPTNQ9Y664 436 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 BTBD17A6NE02 478 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 IFNA10P01566 189 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 IGLV2-23P01705 113 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 DLK1P80370 383 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 SPINK9Q5DT21 86 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 LINC00052Q96N35 136 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 PRSS46E5RG02 174 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-204ENST00000548823 FNDC10F2Z333 226 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms