RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 CCDC140Q96MF4 163 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 COPZ2Q9P299 210 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 V9GYH0 126 aa6.31□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 OR4C46A6NHA9 309 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 E7EUB6 86 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 C8orf88P0DMB2 117 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 NQO2P16083 231 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 PRR20EP86478 221 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 PRR20CP86479 221 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 PRR20DP86480 221 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 PRR20BP86481 221 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 PRR20AP86496 221 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 DEFB135Q30KP9 77 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 BET1LQ9NYM9 111 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 TMEM235A6NFC5 223 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 NOTOA8MTQ0 251 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 TSPAN4O14817 238 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 TGOLN2O43493 480 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 TNFSF12O43508 249 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 CDK2AP2O75956 126 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 HPRT1P00492 218 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 FCGR2CP31995 323 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 TAS2R31P59538 309 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 AP3S2P59780 193 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 ERVK-16P61578 105 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 MSMO1Q15800 293 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 KLK9Q2XQG4 91 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 BEST4Q8NFU0 473 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 RNF183Q96D59 192 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 GALNT14Q96FL9 552 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SOSTQ9BQB4 213 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 HINT2Q9BX68 163 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.29□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 A0A1B0GW64 132 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SMIM30A4D0T7 59 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 OR2T8A6NH00 312 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SULT1C2O00338 296 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 UPK2O00526 184 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 RGS13O14921 159 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 LYRM1O43325 122 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 IGLV2-14P01704 120 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 IFNA4P05014 189 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 OR13C7P0DN81 318 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 RPA2P15927 270 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 C4BPBP20851 252 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 FXYD4P59646 89 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 OR2B8PP59922 312 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 ZNF79Q15937 498 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 BAK1Q16611 211 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 IDNKQ5T6J7 187 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.28□□□□□ -1.4
TROAP-208ENST00000548817 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.28□□□□□ -1.4
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